基于Pytorch使用GPU运行模型方法及注意事项

一、在基于pytorch深度学习进行模型训练和预测的时候，往往数据集比较大，而且模型也可能比较复杂，但如果直接训练调用CPU运行的话，计算运行速度很慢，因此使用GPU进行模型训练和预测是非常有必要的，可以大大提高实验效率。如果还没有配置好运行环境的博友们可以参考下面博主的文章。

1、点击打开《基于Windows中学习Deep Learning之搭建Anaconda+Cudnn+Cuda+Pytorch+Pycharm工具和配置环境完整最简版》文章
2、点击打开《基于Pytorch查看本地或者远程服务器GPU及使用方法》文章

二、具体方法分为两个大部分（模型和数据集）。

• 首先将模型model移动到cuda设备也就是GPU上，注意：此大模型可以内含多个子模型，子模型无需再重复移动到GPU上

model = Net() # 举例模型
device = torch.device("cuda:0" if torch.cuda.is_available() else "cpu") 
model.to(device) # 移动举例模型到cuda

或者

model = Net() # 举例模型
device = torch.cuda.current_device() if args.cuda else torch.device('cpu')
model.to(device) # 移动举例模型到cuda

• 将数据集（包含训练集和测试集及所包含的标签数据集）移动到cuda设备也就是GPU上，使用数据集.cuda()形式完成。

drug_embeddings = drug_embeddings.cuda()
protein_embeddings = protein_embeddings.cuda()
effectives = effectives.cuda()

或者

drug_embeddings = drug_embeddings.to(device)
protein_embeddings = protein_embeddings.to(device)
effectives = effectives.to(device)

三、问题及方法

• 问题 1：torch.FloatTensor和torch.cuda.FloatTensor的差异
  

Input type (torch.FloatTensor) and weight type (torch.cuda.FloatTensor) should be the same or input should be a MKLDNN tensor and weight is a dense tensor

问题中文翻译成

输入类型（torch.FloatTensor）和权重类型（torch.cuda.FloatTensor）应该相同，或者输入应该是MKLDNN张量，权重是密集张量

• 问题 2：数据运算过程中需交互的情况下不在同一个设备上
  

Expected all tensors to be on the same device, but found at least two devices, cuda:0 and cpu!

问题中文翻译成

预期所有张量都在同一设备上，但至少找到了两个设备，cuda:0 和 cpu ！

• 问题1和问题2解决方法（相同）：首先根据错误的提示找到代码中是哪行数据出现的问题，然后针对性的解决，以数据XR出问题举例，分两种情况：第一种情况是如果此数据XR通过torch.FloatTensor（数据XR）构造，那么改成torch.cuda.FloatTensor（数据XR）即可；第二种情况是并非构造数据XR，而是将数据XR传输到另一个子模型中，那么直接在数据XR的后面加上cuda即可，也就是“数据XR.cuda()”即可。
  
  

• 问题 3：代码运行过程中CUDA运输内存不够分配
  

CUDA out of memory. Tried to allocate 490.00 MiB (GPU 0; 2.00 GiB total capacity; 954.66 MiB already allocated; 62.10 MiB free; 978.00 MiB reserved in total by PyTorch) If reserved memory is >> allocated memory try setting max_split_size_mb to avoid fragmentation.  See documentation for Memory Management and PYTORCH_CUDA_ALLOC_CONF

问题中文翻译成

CUDA内存不足。尝试分配490.00 MiB（GPU 0；2.00 GiB总容量；954.66 MiB已分配；62.10 MiB可用；PyTorch总共保留978.00 MiB）如果保留内存>>已分配内存，请尝试设置max_split_size_mb以避免碎片。请参阅内存管理和PYTORCH_CUDA_ALLOC_CONF的文档

• 问题3解决方法：运算内存不够的情况下有两种解决方法，第一种方法一般缩小数据集批次大小，也就是batch_size缩小，比如：可以将原来batch_size=256那么缩小成batch_size=16；第二种就是去服务器上跑代码，也就是更换更好的GPU去运行，如果还是出现同样的问题，那么此两种方法结合使用最好。
  
• 后续出现新的问题会继续更新，敬请期待！